如东县中医院病理科创建于1979年。现为江苏省病理科专科联盟成员单位、如东县县域病理中心，并与上海衡道病理诊断中心成立联合工作站。现有工作人员9人，其中高级职称2人，中级职称2人，初级职称4人。

科室设置报告收发室、标本接收室、取材室、分子病理室、冰冻制片室、细胞制片室、免疫组化室、远程会诊室、病理诊断室、病理档案室；配有全自动组织脱水机、微波组织快速处理仪、SLEE冰冻切片机、epredia冰冻切片机、BD自动液基薄层细胞制片机、Lecia全自动免疫组化仪、Nikon显微镜及朗伽病理图文报告工作站等设备。开展常规石蜡切片病理诊断、术中快速病理诊断、细胞学病理诊断、免疫组化染色与诊断、HPV mRNA E6/E7检测，服务项目满足临床诊疗需要。

科室于2017年荣获南通市抗癌协会消化道早癌病理诊断比赛三等奖，2022年荣获如东县优秀自然科学论文一等奖，2023年荣获南通市获新技术引进三等奖。