1958年8月建院时,设门诊、针灸两科室,职工12人。
1959年8月,更名为“如东县中医院”。
1975年10月医院搬迁至如东县掘港镇江海中路50号。病床增加到100张。
1995年2月,核定床位增加至160张。同年12月,被评定为“二级甲等中医院”。
1996年2月,核定床位增设至200张。9月,核定为“爱婴医院”。12月,经江苏省教委核定为“江苏省高校实习基地”。
2010年,核定医院床位增至300张。通过二级甲等中医医院复核评审。
2014年9月,核定医院床位增至400张。
2015年7月,核定医院床位增加至800张。
2017年7月,整体搬迁至如东经济开发区淮河路66号。同年6月被评定为三级乙等中医医院。
2021年,成立周仲瑛国医大师传承工作室如东县中医院工作站,三级公立中医医院绩效考核(国考)江苏省排名14名,南通市县级中医院排名第一,医保运行效率在南通医保数据中排名第一。
2023年1月,院党委正式启动三级甲等中医院创建工作,更好地为如东百万群众健康事业保驾护航。